當有機還原碳被埋藏到地底下，會使得氧氣在大氣圈儲存庫的量增加；但同時也使得二氧化碳在大氣儲存庫的量減少。氧氣在大氣中的存在量，主要由有機碳的埋藏速率決定，其他的因素則會影響大氣中的二氧化碳含量，像是：地表岩石、土壤中的化學作用造成礦物的生成、破壞。
地表化學風化作用會消耗大氣中的二氧化碳，二氧化碳 ( CO2 ) 與大氣中的水 (H2O ) 結合形成碳酸 ( carbonic acid，H2CO3 )，碳酸會侵蝕石灰岩 ( limestone, CaCO3 )及矽酸岩 ( silicate rocks )，放出溶在水中的二價的鈣離子 ( Ca2+ ) 及帶負電的碳酸氫根離子 ( HCO3- )，它們會隨著河水流到海洋，再重新結合生成碳酸鈣 ( CaCO3 )，如同我們所觀察的，這些碳酸鈣或由溫暖海洋中的無機作用沉澱；或由生物體分泌形成骨骼，因此石灰岩的生成來源有可能是生物作用沉積，或化學作用沉積。
最後，變質 ( metamorphism ) 及融熔 ( melting ) 高溫、高壓作用會打斷碳酸鈣沉積物的鍵結，使二氧化碳又重新回到大氣中。
